FHS sendiri dikembangkan oleh Linux Foundation yang telah
dikembangkan sejak Agustus Tahun 1993 dengant tujuan untuk
menstrukturisasi file dan direktori pada Linux yang berbasis GNU. Pada
waktu itu masih bernama FSSTND (Filesystem Standard) pada Tahun 1994,
yang kemudian menjadi FHS di khususkan kepada Sistem Operasi GNU atau
Linux yang kita pakai sekarang.Tujuan awal Standarisasi FHS sendiri untuk mempermudah dalam pengaplikasian, system admin, pengembangan.